San Francesco del Deserto a Velencei lagúna egy aprócska szigete a Sant'Erasmo-sziget és Burano között, a lagúna déli, kissé elhagyatott területén. Velence közigazgatása alá tartozik. Buranóról csónakon kb. 20 perc alatt közelíthető meg. Területe mindössze két hektárnyi.

1220-ban még Isola delle Due Vigne néven volt ismert. Ebben az esztendőben Assisi Szent Ferenc ezt a szigetet választotta visszavonulásának színhelyéül. 1233-ban aztán Jacopo Michiel a franciskánus szerzeteseknek adta a szigetet.

Mostani elnevezése arra utal, hogy a XV. században szinte kihalt, lakatlan területté vált. 1460-ban új templomot emeltek rajta az egykori helyén, ma csupán tíz szerzetes éli itt mindennapjait.